Le plateforme analytique

Au sein du BioPark d’Archamps, le service MassOmics explore le monde du vivant au travers de prestation de service et de projets de recherche collaboratifs.

Contrôle de pureté

Qu’il s’agisse de protéines recombinantes, d’extraits cellulaires, de fluides biologiques complexes, de produits de synthèse organique ou encore de composés thérapeutiques, notre infrastructure et nos compétences vous accompagnent dans la mise en place d’une analyse de pureté de vos échantillons.

Imagerie moléculaire

MALDI-TOF MS

Comment cartographier la répartition moléculaire en cultures cellulaires ou au sein d’un organisme entier en passant par des prélèvements histologiques ciblés (résections, biopsies)? Nous vous proposons notre expertise et notre savoir-faire en matière d’imagerie moléculaire par MALDI MS et MS/MS sur des prélèvements histologiques ciblés d’origines diverses (tissus animaux et végétaux).

Analyses structurales par MS/MS

Nous réalisons vos analyses d’empreintes massiques de peptides/protéines et lipides par MALDI MS et MS/MS (AutoFlex III, Bruker Daltonik), de protéomie Top-Down et Bottom-Up à haute résolution spectrale (Q-Exactive, Thermo Scientific) en couplage nanoHPLC mono ou bidimensionnelle, microUPLC (Agilent 1290) et HPLC analytique (Agilent 1260). Nous vous proposons également des analyses par électrophorèse 1D en SDS-PAGE, et d’élucidation structurale des protéines et de leurs modifications post-traductionnelles (agencement des ponts disulfures, site de phosphorylation, séquences protéolytiques, détermination de linkers covalents, etc.) et des lipides. Nous pouvons également vous accompagner dans l’analyse de petites molécules par GC-MS.

"Omics" différentielles

Nous assurons vos analyses différentielles par peptidomique, protéomique et lipidomique sur différentes matrices biologiques complexes telles que fluides biologiques, extraits de tissus, organes ou organismes entiers. Nous réalisons également la caractérisation de sécrétomes issus de modèles de co-culture 3D in vitro en réponse à des agents biotiques et abiotiques (toxicants, allergènes, médicaments, etc.). Nous mettons à votre service nos compétences en matière de caractérisation moléculaire et de quantification « omics » par approche label-free afin d’accompagner vos projets.

Préparation d'échantillons

Pour que vos projets soient des succès, nous vous offrons une assistance complète ou partielle à la préparation des échantillons de nature biologique (tissus animaux et végétaux) ou chimique (extraction biochimique, purification, dessalage, inclusion de tissus, coupes histologiques). En interaction avec votre équipe, nous sélectionnons, construisons et validons ensemble les protocoles de préparation des échantillons à façon, dans le respect de la compatibilité chimique et technologique des analyses par spectrométrie de masse. Ce travail interactif peut entrer dans le cadre d’une preuve de concept de faisabilité incluant un rapport d’activité dans lequel les ajustements et le protocole seront délivrés. Une formation technique sur site peut-être envisagée.